Biała Woda utworzyła się na skutek erozji bocznej rzeki lub zasypania aluwiami istniejącej doliny. W przeważającej części jest płaskodenna. W zboczach widoczne są warstwy globigerinowo-radiolariowe. Dno w górnym odcinku jest niewyrównane, a woda płynie w nim jedynie po większych ulewach. W środkowej części na niewielkim obszarze znajdują się formy pochodzenia rzeczno-denudacyjnego - powierzchnie zrównań oraz, w zwietrzelinie, zlepieńce zawierające otoczaki z Pienińskiego Pasa Skałkowego. W dolnym odcinku u podnóża skałek występują drobnoziarniste piaskowce z mikami, po stronie północnej zaś ewenement geologiczny -
Skałka Bazaltowa.